مدلسازی و پیش بینی فراهمی زیستی دسته ی وسیعی از داروها با استفاده از روش qsar

پایان نامه
چکیده

فراهمی زیستی سری متنوعی از 216 ترکیب دارویی خوراکی با استفاده از پارامترهای ساختاری آنها و با بهره گیری از رویکرد qsar تخمین زده شد. بدین منظور توصیف کننده های مولکولی برای این ترکیبات محاسبه شده و پس از بررسی و پالایش اولیه، 9 توصیف کننده مهمتر انتخاب گردید. با استفاده از این توصیف کننده ها مدل های خطی و غیر خطی جهت پیش بینی فراهمی زیستی با استفاده از روش های رگرسیون خطی چندگانه (mlr)، شبکه عصبی مصنوعی ann)) و ماشین بردار پشتیبان (svm) ساخته شد. کیفیت و اعتبار مدل های پیشنهادی نیز با استفاده از روش های ارزیابی داخلی و خارجی مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل نشان دهنده برتری مدل مبتنی بر svm بر سایر مدل ها می ‎باشد. پارامترهای آماری این مدل برای سری آموزشی 97/0r= و 72/5se = و برای سری آزمون 93/0r= و 46/10se= به دست آمد. سپس قلمرو کاربرد مدل نیز برای مدل ارائه شده محاسبه گردید. در قسمت دوم فراهمی زیستی 84 ترکیب دارویی با ادغام توصیف کننده های مولکولی و پارامترهای معادله روابط انرژیآراد خطی ((lfer مدلسازی و محاسبه شد. از بین توصیف کننده های محاسبه شده مهمترین آنها به روش انتخاب متغیر مرحله ای انتخاب گردید. این توصیف کننده ها شامل دو پارامتر معادله lfer و 7 توصیف کننده توپولوژیکی و الکترونی بودند. به منظور ایجاد مدل های روابط کمی ساختار-فعالیت در روش های مدلسازی mlr، svm و ann استفاده شد. بر مبنای نتایج حاصل مدل svm از سایر مدل ها بهتر بوده و پارامترهای آماری آن 98/0 r=و 18/5se= برای سری آموزشی و 95/0r= و 73/7 se= برای سری آزمون به دست آمدند. ارزیابی میزان اعتبار این مدل با روش ارزیابی تقاطعی صورت پذیرفت و که پارامترهای آماری حاصل از آن نشان دهنده قابلیت مدل می باشد. نتایج حاصل نشان دهنده توانایی روش qsar در مدلسازی فراهمی زیستی داروهای خوراکی بوده و می تواند در جهت طراحی داروهایی با خواص فراهمی زیستی مناسب مورد استفاده قرار گیرد.

منابع مشابه

The effect of cyclosporine on asymmetric antibodies and serum transforming growth factor beta1 in abortion-prone model of mice CBA/J x DBA/2

كچ ي هد فده و هقباس : ي ک ي طقس زورب للع زا اه ي ،ررکم ا لماوع تلاخد ي ژولونوم ي ک ا رد ي ن قم طققس عون ي وراد دقشاب ي س ي روپسولک ي ،ن ح لدم رد طقس شهاک بجوم ي ناو ي CBA/j×DBA/2 م ي تنآ ددرگ ي داب ي اه ي ان و راققتم TGF-β لماوع زا عت مهم يي ن گلماح تشونرس هدننک ي سررب روظنم هب رضاح هعلاطم تسا ي ات ث ي ر اس ي روپسولک ي ن م رب ي از ا ي ن تنآ عون ي داب ي س و اه ي اکوت ي ن TGF...

متن کامل

The Study of Stressful Factors in Clinical Education for Nursing Students Studying in Nursing and Midwifery College in Khorramabad

کچ هدي پ شي مز هني فده و : شزومآ لاب يني شخب ساسا ي شزومآ مهم و راتسرپ ي تسا . و هنوگ ره دوج لکشم ي شزومآ رد لاب يني ، آراک يي هدزاب و ا ني شزومآ زا شخب راچد ار لکشم م ي دنک . فده اب رضاح شهوژپ سررب ي لماوع سرتسا از ي شزومآ لاب يني رد وجشناد ناي راتسرپ ي هدکشناد راتسرپ ي و يامام ي ماـجنا داـبآ مرـخ تسا هتفرگ . شور و داوم راک : رضاح هعلاطم کي هعلاطم صوت يفي عطقم ي تسا . د...

متن کامل

پیش بینی خواص بیولوژیکی و ترمودینامیکی برخی داروها و ترکیبات آلی با استفاده از روش qsar و qspr

در این رساله در صدد هستیم که با استفاده از روش qsar ارتباط منطقی بین ساختار و فعالیت 38عدد از ترکیبات ضد قارچ را بر روی فعالیت بیولوژیکی حداقل غلظت بازدارنده (mic50) آن ها بدست آوریم. در این تحقیق توصیف کننده های مختلف برای هر مولکول با استفاده از نرم افزار های هایپرکم، کم تری دی آلترا، و دراگون محاسبه شده است. سپس با استفاده از نرم افزارمطلب همبستگی بین داده ها حذف شده و در نهایت با استفاده از...

15 صفحه اول

پیش بینی قیمت نفت با استفاده از روش متا آنالیز

نفت یک کالای مهم اقتصادی و قیمت آن در بازارهای بین‌المللی بسیار اثرگذار و توانایی ارائه پیش‌بینی صحیح از وضعیت قیمت آن یکی از چالش‌های مهم علمی در سراسر جهان است. این مقاله به پیش‌بینی قیمت نفت با استفاده از روش متا آنالیز و مقایسه آن با سایر روش‌ها می‌پردازد. در این تحقیق از نتایج روش‌های ARMA،AR فازی، تاناکا فازی، حداقل مربعات فازی، شبکه عصبی، داده‌های شبیه‌سازی شده و داده‌کاوی مربوط به قیمت‌...

متن کامل

پیش بینی بازده سهام با استفاده از روش انقباضی LASSO

انتخاب متغیر، یکی از مراحل مهم در مدل­سازی آماری است. برای این منظور، معمولاً از روش­هایی نظیر حذف پسرو استفاده می­شود. از آنجایی که در این روش­ها دو مرحله ی برآورد مدل و انتخاب متغیر به طور جداگانه صورت می­گیرد، نتیجه­ی حاصل بی­ثبات خواهد بود. به همین دلیل اخیراً گروه دیگری از روش­های انتخاب متغیر به نام روش­های انقباضی مطرح شده­اند که در این بین، LASSO از محبوبیت ویژه­ای برخوردار است. در این تح...

متن کامل

مدلسازی و پیش بینی صادرات آبزیان دریایی در ایران با استفاده از روش ARIMA و شبکه های عصبی مصنوعی

هدف اصلی این مقاله، مدلسازی و پیش بینی میزان صادرات آبزیان دریایی در ایران است. برای این منظور، از روش های سری زمانی خود توضیح جمعی میانگین متحرک(ARIMA) و شبکه عصبی مصنوعی استفاده می شود. به منظور انجام بررسی، از داده های ماهانه دوره 1374:03 تا 1387:12 برای برآورد و آموزش مدل و از داده های دوره از 1388:01 تا 1390:12 به منظور بررسی قدرت پیش بینی مدل های مختلف استفاده می شود. در این مطالعه، معیار...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده شیمی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023